מותר, וכדאי לאמרה בטעמים (עיין הלכה ברורה ח"ד סימן נ"ט סעיף י').
אם מתפללים ערבית אחר צאת השבת, כדאי שתדאג לסדר את ההבדלה לפני התפלה. חבל לך להפסיד קדושה עם הציבור.