ייחוסו רבי יונה בעל הספר איסור והיתר הארוך חלת לחם - יהושע השעיל הכהן מתוך הקדמת המחבר מגילת יוחסין ...והגאון רבי אפרים נפתלי הירש מבריסק הנ׳׳ל, היה בן הג״ר יוסף יונה זצי׳ל בנו של הגאון המקובל רבי קלונימוס קלמן זצללה״ה, שהיה ר״מ בק״ק קראקא ובריסק, בן הגאון הגדול רבי יונה ב״ר ישראל מרעגנשבורג זצללה״ה בעל איסור והיתר, וחתן הגאון הגדול רבי יונה ווייל זצללה״ה אבדק״ק באמבערג שוואבן, בן הגאון הגדול רבי יעקב ווייל זצללה״ה אבדק״ק דונא ווירטה, בן הגאון הגדול רבי מאיר ווייל זצללה״ה שהיה אב״ד דכל מדינות אולמי, אשר היה מחשובי רבני אשכנז המובהקים אשר בימי קדם, גדול ומפורסם בדורו. והנה משפחת ווייל הרוממה, כידוע שהיתה משפחה מפוארה בישראל, ונפוצה בארצות אשכנז וצרפת, מהן גאונים גדולים ואדירים, מהן חכמים וחקרי לב, נגידים ואנשי שם לכבוד ולתפארת בקרב הארץ, ואין כאן המקום לפרוט שמות כולן ולהאריך בתולדותיהן.